Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casq1O09165 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casq1O09165 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Casq1O09165 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Casq1O09165 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Casq1O09165 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms