Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MttpO08601 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MttpO08601 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MttpO08601 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MttpO08601 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MttpO08601 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MttpO08601 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MttpO08601 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MttpO08601 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MttpO08601 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MttpO08601 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MttpO08601 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MttpO08601 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MttpO08601 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MttpO08601 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MttpO08601 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MttpO08601 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MttpO08601 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MttpO08601 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MttpO08601 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MttpO08601 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MttpO08601 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MttpO08601 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MttpO08601 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MttpO08601 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MttpO08601 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MttpO08601 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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MttpO08601 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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MttpO08601 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MttpO08601 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MttpO08601 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MttpO08601 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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MttpO08601 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MttpO08601 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MttpO08601 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MttpO08601 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MttpO08601 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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MttpO08601 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MttpO08601 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MttpO08601 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MttpO08601 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MttpO08601 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MttpO08601 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MttpO08601 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MttpO08601 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MttpO08601 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MttpO08601 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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MttpO08601 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MttpO08601 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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MttpO08601 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MttpO08601 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MttpO08601 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MttpO08601 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MttpO08601 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MttpO08601 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MttpO08601 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MttpO08601 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MttpO08601 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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MttpO08601 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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MttpO08601 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MttpO08601 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MttpO08601 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MttpO08601 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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MttpO08601 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MttpO08601 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MttpO08601 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MttpO08601 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MttpO08601 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MttpO08601 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MttpO08601 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MttpO08601 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MttpO08601 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MttpO08601 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MttpO08601 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MttpO08601 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MttpO08601 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MttpO08601 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MttpO08601 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MttpO08601 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MttpO08601 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MttpO08601 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MttpO08601 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MttpO08601 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MttpO08601 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MttpO08601 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MttpO08601 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MttpO08601 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MttpO08601 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms