Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms