Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Usp35M0QWN7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Usp35M0QWN7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Usp35M0QWN7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Usp35M0QWN7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Usp35M0QWN7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Usp35M0QWN7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Usp35M0QWN7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Usp35M0QWN7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Usp35M0QWN7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Usp35M0QWN7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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