Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm17577J3QNF7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms