Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc180J3QNE4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc180J3QNE4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
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