Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm3336J3QMQ6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm3336J3QMQ6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm3336J3QMQ6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm3336J3QMQ6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm3336J3QMQ6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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