Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms