Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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