Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rnf212F6TQD1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rnf212F6TQD1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rnf212F6TQD1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rnf212F6TQD1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rnf212F6TQD1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rnf212F6TQD1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rnf212F6TQD1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rnf212F6TQD1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf212F6TQD1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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