Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms