Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

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Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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