Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Gm21394-202ENSMUST00000189463 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Gm20806-202ENSMUST00000190349 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3250E9Q1M3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms