Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms