Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms