Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ppfia1B2RXQ2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia1B2RXQ2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia1B2RXQ2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia1B2RXQ2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia1B2RXQ2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia1B2RXQ2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia1B2RXQ2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia1B2RXQ2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia1B2RXQ2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia1B2RXQ2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia1B2RXQ2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia1B2RXQ2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia1B2RXQ2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia1B2RXQ2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia1B2RXQ2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia1B2RXQ2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia1B2RXQ2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia1B2RXQ2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia1B2RXQ2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms