Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms