Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms