Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms