Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms