Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Atp8b5A3FIN4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Atp8b5A3FIN4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Atp8b5A3FIN4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Atp8b5A3FIN4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Atp8b5A3FIN4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Atp8b5A3FIN4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Atp8b5A3FIN4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Atp8b5A3FIN4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Atp8b5A3FIN4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Atp8b5A3FIN4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms