Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ckap5A2AGT5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms