Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms