Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
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