Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd3Q9Z2D8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd3Q9Z2D8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms