Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtmr1Q9Z2C4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms