Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn6Q9Z262 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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