Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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