Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ap3b1Q9Z1T1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms