Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lgr5Q9Z1P4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms