Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec2Q9WV35 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec2Q9WV35 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec2Q9WV35 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec2Q9WV35 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec2Q9WV35 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec2Q9WV35 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms