Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU66

Sfrp5, Secreted frizzled-related protein 5, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp5Q9WU66 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Sfrp5Q9WU66 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp5Q9WU66 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms