Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam50bQ9WTJ8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms