Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0P4

Smap, Small acidic protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmapQ9R0P4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SmapQ9R0P4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms