Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav3Q9R0C8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Vav3Q9R0C8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Vav3Q9R0C8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Vav3Q9R0C8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Vav3Q9R0C8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Vav3Q9R0C8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav3Q9R0C8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Vav3Q9R0C8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav3Q9R0C8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav3Q9R0C8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav3Q9R0C8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Vav3Q9R0C8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav3Q9R0C8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav3Q9R0C8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav3Q9R0C8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav3Q9R0C8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav3Q9R0C8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav3Q9R0C8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav3Q9R0C8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav3Q9R0C8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav3Q9R0C8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav3Q9R0C8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav3Q9R0C8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav3Q9R0C8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vav3Q9R0C8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vav3Q9R0C8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vav3Q9R0C8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vav3Q9R0C8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vav3Q9R0C8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vav3Q9R0C8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vav3Q9R0C8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Vav3Q9R0C8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Vav3Q9R0C8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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