Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms