Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmQ9QXG2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms