Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gde1Q9JL56 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gde1Q9JL56 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gde1Q9JL56 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gde1Q9JL56 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gde1Q9JL56 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gde1Q9JL56 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gde1Q9JL56 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gde1Q9JL56 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gde1Q9JL56 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gde1Q9JL56 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gde1Q9JL56 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gde1Q9JL56 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Gde1Q9JL56 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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