Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms