Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tmod2Q9JKK7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod2Q9JKK7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms