Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trem1Q9JKE2 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trem1Q9JKE2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trem1Q9JKE2 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trem1Q9JKE2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trem1Q9JKE2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trem1Q9JKE2 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trem1Q9JKE2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trem1Q9JKE2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trem1Q9JKE2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trem1Q9JKE2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trem1Q9JKE2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trem1Q9JKE2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trem1Q9JKE2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trem1Q9JKE2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trem1Q9JKE2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trem1Q9JKE2 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trem1Q9JKE2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trem1Q9JKE2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trem1Q9JKE2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trem1Q9JKE2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trem1Q9JKE2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trem1Q9JKE2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trem1Q9JKE2 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trem1Q9JKE2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trem1Q9JKE2 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trem1Q9JKE2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms