Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms