Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn2Q9ER65 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms