Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms