Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms