Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trmt112Q9DCG9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trmt112Q9DCG9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trmt112Q9DCG9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt112Q9DCG9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt112Q9DCG9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt112Q9DCG9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt112Q9DCG9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt112Q9DCG9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt112Q9DCG9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt112Q9DCG9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt112Q9DCG9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt112Q9DCG9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt112Q9DCG9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt112Q9DCG9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt112Q9DCG9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt112Q9DCG9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt112Q9DCG9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt112Q9DCG9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt112Q9DCG9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt112Q9DCG9 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt112Q9DCG9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt112Q9DCG9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt112Q9DCG9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt112Q9DCG9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt112Q9DCG9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt112Q9DCG9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trmt112Q9DCG9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms