Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC60

Ubiad1, UbiA prenyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubiad1Q9DC60 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubiad1Q9DC60 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms