Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmg20aQ9DC33 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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