Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms