Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Xrn2Q9DBR1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms